2026年4月15日,由中國醫(yī)學裝備協(xié)會基因檢測分會、醫(yī)療輔助技術(醫(yī)學檢驗)國家臨床醫(yī)學研究中心、中華醫(yī)學會檢驗醫(yī)學分會臨床微生物學組聯(lián)合制定的 《宏基因組高通量測序技術臨床實驗室規(guī)范化應用指南(2026版)》 正式發(fā)布。

這是繼2020—2025年多部mNGS相關共識之后,首部系統(tǒng)覆蓋 “濕實驗+干實驗”全流程、以實驗室規(guī)范化建設為核心的指南性文件,標志著我國mNGS臨床檢測從“能用”向“規(guī)范用”室之間的結果差異大,臨床解讀困難重重?!凹夹g越強,規(guī)范越急”。此次指南的出臺,正是為了解決實驗室在環(huán)境分區(qū)、人員資質(zhì)、試劑耗材、軟件數(shù)據(jù)庫、質(zhì)控體系、性能確認、結果判讀**等方面的現(xiàn)實痛點。
指南圍繞15個關鍵問題,形成15條推薦意見(其中14條為“建議”,1條為“考慮”),以下為IVD從業(yè)者最應關注的內(nèi)容: 1. 明確預期用途(推薦意見1) 實驗室開展的mNGS檢測項目需有明確的臨床預期用途,包括疾病類型/癥候群、標本類型、適用人群、檢測核酸類型(DNA/RNA)及臨床意義。 解讀:不能“為了測而測”,每項mNGS產(chǎn)品/方法必須有清晰的臨床定位。 2. 實驗室分區(qū)與流向(推薦意見2) 應設置試劑準備區(qū)、標本制備區(qū)、文庫制備區(qū)、文庫擴增區(qū)(如適用)、測序區(qū),單一流向。 血液/腦脊液等無菌標本與下呼吸道等有菌標本的提取應在不同區(qū)域或不同批次。 不推薦與常規(guī)PCR共用區(qū)域;如確需共用,必須按mNGS標準管理。 解讀:污染是mNGS的頭號敵人,分區(qū)和流向是硬性門檻。 3. 人員資質(zhì)(推薦意見3) 人員必須通過省級以上指定機構組織的基因擴增檢驗技術培訓,并通過內(nèi)部制度化培訓考核。 解讀:mNGS不是普通PCR,人員能力要求更高,培訓必須“雙保險”。 4. 儀器設備(推薦意見4) 新測序儀安裝后需進行安裝確認,更換儀器后需用已知樣本平行檢測,結果一致方可使用。每次實驗后必須有儀器清潔程序。 解讀:測序儀的“身份證”和“體檢報告”缺一不可。 5. 試劑、耗材、軟件、數(shù)據(jù)庫(推薦意見5) 每批次試劑必須進行背景微生物確認。 耗材需有控菌措施(如高壓滅菌、濾芯吸頭)。 軟件更新后必須用至少3個舊數(shù)據(jù)重新驗證。 數(shù)據(jù)庫原則上非必要不更新;若更新,必須用至少10個舊數(shù)據(jù)驗證,覆蓋細菌、真菌、DNA/RNA病毒、寄生蟲。 解讀:數(shù)據(jù)庫一換,結果天差地別——這是很多實驗室忽視的“隱形炸彈”。 6. 標準化操作程序(SOPs)(推薦意見6) 應建立與常規(guī)方法(培養(yǎng)、PCR、快速檢測、血清學)相結合的臨床檢驗路徑,明確何時啟動mNGS。SOPs須覆蓋分析前、中、后全流程,包括cut-off值建立。 解讀:mNGS不是“萬能替代”,而是“補充精裝”——先用常規(guī),再上mNGS,這是臨床落地的最佳實踐。 7. 標本采集、運輸、接收、保存(推薦意見7) 必須在潔凈區(qū)域采集,使用無菌、去核酸的采集管,采集后立即密封、一次性封裝。實驗室須建立標本質(zhì)檢程序,不合格標本需明確處理流程(拒收、重采或讓步檢測)。 解讀:標本質(zhì)量決定結果質(zhì)量,很多假陰性源于采集運輸環(huán)節(jié)的“坑”。 8. “濕實驗”流程(推薦意見8) 須監(jiān)測核酸提取濃度、文庫濃度、測序數(shù)據(jù)量、Q30等關鍵質(zhì)量值。 解讀:不能只看最終有沒有病原體,中間每一步的“質(zhì)量值”才是可控性的體現(xiàn)。 9. “干實驗”流程(推薦意見9) 必須建立覆蓋原始數(shù)據(jù)質(zhì)控→宿主序列過濾→物種注釋的SOPs,明確軟件版本、參數(shù)、數(shù)據(jù)庫版本及質(zhì)量值要求(如過濾后有效數(shù)據(jù)量、非宿主數(shù)據(jù)占比等)。 解讀:生信不是“黑箱”,每一步都必須可追溯、可質(zhì)控。 10. 結果判讀:陽性判斷值與背景數(shù)據(jù)庫(推薦意見10) 必須使用具有陽性判斷值(cut-off值)的mNGS方法,可通過ROC曲線建立。同時必須建立背景微生物數(shù)據(jù)庫(涵蓋試劑、環(huán)境、耗材),用于排除外源污染導致的假陽性。結果判讀原則:先按cut-off判陰陽,再排除背景污染,最后給出最終結果。 解讀:沒有cut-off的mNGS就是“耍流氓”;不建背景庫,假陽性滿天飛。 11. 參考物質(zhì)(推薦意見11) 臨床標本難以大量獲得時,可使用模擬樣本(含人源核酸+病原體核酸,基質(zhì)與臨床一致)。干實驗可采用計算機模擬數(shù)據(jù)。 解讀:參考物質(zhì)是性能確認、質(zhì)控、室間質(zhì)評的“標尺”,不能隨意湊合。 12. 性能確認(推薦意見12) 對每一類病原體(DNA病毒、RNA病毒、革蘭陽性菌、革蘭陰性菌、真菌、寄生蟲)選擇代表性菌株,驗證精密度(重復性+重現(xiàn)性)、分析靈敏度(LoD)、分析特異性、準確度、交叉污染。 三種可簡化情形: mNGS僅作為補充檢測; 曾做過完整性能確認(僅修改cut-off需重做); 陽性結果均采用另一種方法(NMPA批準試劑或經(jīng)過驗證的自建方法)確認。 解讀:性能確認是合規(guī)的“入場券”,但指南給出了靈活通道,避免過度“內(nèi)卷”。 13. 室內(nèi)質(zhì)量控制(推薦意見13) 陽性質(zhì)控品:每批檢測弱陽性(1.5~3倍LoD),覆蓋多類病原體。 陰性質(zhì)控品:監(jiān)測外源污染,失控需分析原因。 內(nèi)參:每個標本加外源性內(nèi)參,監(jiān)測檢測有效性。 標簽(UDI):監(jiān)測交叉污染。 定期進行擦拭實驗(Swipe tests)監(jiān)測實驗室表面污染。 解讀:質(zhì)控不是“做樣子”,內(nèi)參+陰陽性對照+標簽+環(huán)境擦拭,四重防線。 14. 室間質(zhì)量評價(推薦意見14) 定期參加EQA/PT;如無,與至少兩家外部實驗室進行比對。 解讀:閉門造車不可取,EQA是發(fā)現(xiàn)系統(tǒng)性問題的“照妖鏡”。 15. 結果報告與解釋(推薦意見15) 報告至少包含:患者信息、標本信息、檢測信息、實驗室信息、結果信息(病原體名稱、豐度參數(shù)如RPM、耐藥基因如適用)。不推薦常規(guī)報告測序深度等過程參數(shù)。結果解釋必須結合臨床,陰性不能排除感染,耐藥基因需謹慎解讀。 解讀:報告不是數(shù)據(jù)堆砌,要讓臨床醫(yī)生看得懂、用得上。 ※指南的行業(yè)意義 1. 填補了“實驗室規(guī)范化”的空白:以往共識多聚焦臨床應用,這次聚焦實驗室自身建設,直擊“操作不規(guī)范、結果不可靠”的痛點。 2. 強調(diào)污染控制與背景數(shù)據(jù)庫:首次明確提出每批次試劑背景確認、定期擦拭實驗、建立本地背景微生物庫,這是mNGS質(zhì)量保證的“生命線”。 3. 性能確認給出簡化路徑:避免了“一刀切”式的過度驗證,尤其利好開展補充檢測或已有完整驗證的實驗室。 4. 結果判讀回歸臨床:cut-off+背景庫+臨床溝通,三管齊下,減少“假陽性恐慌”和“假陰性漏診”。 ※對IVD企業(yè)的影響 試劑盒開發(fā):必須配套明確cut-off值和背景數(shù)據(jù)庫建立方法,不能只賣“通用方案”。 自動化儀器:交叉污染驗證(強陽性+陰性交叉模式,連續(xù)5批)成為標配。 生信軟件:更新驗證要求提高,數(shù)據(jù)庫版本管理成為監(jiān)管重點。 參考物質(zhì):模擬樣本市場需求將顯著增長,特別是含人源背景、片段化cfDNA模擬血漿等。 ※結語 2026版mNGS規(guī)范化指南,是國內(nèi)感染病原宏基因組檢測領域從“野蠻生長”走向“精耕細作”的重要里程碑。對于IVD從業(yè)者而言,這既是一次合規(guī)挑戰(zhàn),也是一次能力分化的機遇。 聲明:本文所用視頻、圖片、文字部分來源于互聯(lián)網(wǎng),版權屬原作者所有。如涉及到版權問題,請及時和我們聯(lián)系,核實后協(xié)商處理或刪除。